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生命科学系データベースアーカイブ

GDBS

データベースの説明

データベース全般

info 名称 GDBS
info 名称の読み方 ジーデービーエス
info 別名 Gene Diversity DataBase System
info DOI
info 作成者
作成者氏名:
五條堀 孝*
作成者英名:
Takashi Gojobori
作成者所属:
国立遺伝学研究所
作成者氏名:
猪子 英俊
作成者英名:
Hidetoshi Inoko
作成者所属:
東海大学 医学部
info 連絡先

(独)産業技術総合研究所
バイオメディシナル情報研究センター
今西 規(Imanishi Tadashi)
Email: gdbs_address
Tel:(代表)03-3599-8800

info データベース分類 ヒト遺伝子/疾患-多型データベース全般
info 生物種
生物種名:
Homo sapiens
Taxonomy ID:
info データベースの説明

NEDO遺伝子多様性モデル解析事業(http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/show/lsdb_project/19)において実施された、自己免疫疾患(関節リウマチ、尋常性乾癬)及び摂食障害に関連するSNPsを同定するためのタイピングデータ。実験の進行順に以下の3種類のタイピングデータが公開されている。

  1. pooled DNAタイピング
  2. 個別タイピング
  3. SNPタイピング
info データベースの特長・有用性・活用方法

モデル疾患として選択した多因子性疾患について収集した遺伝子多型情報(JBIRCで収集し実験で多型性を確認したマイクロサテライト等)の2つのデータ ベースと疾患関連遺伝子を同定する実験・解析フロー(各種の検定、連鎖不平衡係数推定、集団のハプロタイプ頻度推定、ハプロタイプ組合せ分布推定等)のた めの7つの解析ツールである。Web上の解析サービスは平成19年3月で終了しました。解析ソフトウェアダウンロードサービスは利用可能である。

info データベースの利用許諾 CC 表示-継承 詳細
info 予算的背景・プロジェクト
名称:
NEDO遺伝子多様性モデル解析事業
info 論文等
文献名:
Whole genome association study of rheumatoid arthritis using 27,039 microsatellites.
著者名:
Tamiya G, Shinya M, Imanishi T, Ikuta T, Makino S, Okamoto K, Furugaki K, Matsumoto T, Mano S, Ando S, Nozaki Y, Yukawa W, Nakashige R, Yamaguchi D, Ishibashi H, Yonekura M, Nakami Y, Takayama S, Endo T, Saruwatari T, Yagura M, Yoshikawa Y, Fujimoto K, Oka A, Chiku S, Linsen SEV, Giphart MJ, Kulski JK, Fukazawa T, Hashimoto H, M Kimura, Hoshina Y, Suzuki Y, Hotta T, Mochida J, Minezaki T, Komai K, Shiozawa S, Taniguchi A, Yamanaka H, Kamatani N, Gojobori T, Bahram S, Inoko H.
雑誌名/掲載年月/号:
Hum Mol Genetics 14: 2305-2321, 2005.

データベースのオリジナルサイト情報

info データベース運用場所

産業技術総合研究所 バイオメディシナル情報研究センター

info オリジナルサイト 運用終了
info 運用開始年月日 2005
info 最終更新年月日 2007
info 統括サイト
info データの一括ダウンロードサイト -
info 参照先データベース

NCBI(http://www.ncbi.nlm.nih.gov)

info 一覧表示 有り
info クエリ検索 有り
info Webサービス 無し
info WebサービスURL -
info ユーザ登録 無し

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