史料編纂所には、史料の研究と編纂のために蒐集・購入した多くの史料・図書が収蔵されています。

史料編纂所には、100年以上にわたって全国を採訪し、本所において作成した複製史料が多数所蔵されています。複製史料には複製方法によって影写本・謄写本・写真帳などの種類があります。

寄贈・移管・購入等によって受け入れた多数の原本・写本類を所蔵しています。国宝・重要文化財に指定されたものや、まとまって伝来した史料群(特殊蒐書)など多くの貴重書があります。

一般図書の中には古い木版本や洋古書が含まれています。また、編纂・研究のために、史料所蔵機関の蔵書目録、地方史誌、学術図書・雑誌の充実に努め、所外の研究者にも公開しています。

長い年月を経てきた本所所蔵史料には、傷みや劣化が進んでいるものも多く含まれます。史料の抱える問題を改善し、将来にわたって伝えていくために、教員と技術室職員とが協力して修理を実施しています。解体の際にしかできない調査を行ったり、装備をあらためて史料の原態を復元したりするなど、修理の機会を活用した研究にも積極的に取り組 んでいます。