生命をシステムとして理解するための要素技術として、大量の表現型画像データを用いた多次元QTL解析手法、テキストマイニングを用いた大規模実験の解釈手法、実験手法に関する情報のテキストからの抽出手法、論文中の図表の種類を判別するための手法、大量のゲノム配列情報を用いたゲノムおよび遺伝子ネットワークの進化解析手法、複数の生物種の生命ネットワークの比較手法、および複雑なネットワークデータの解釈のための可視化手法をそれぞれ開発した。