docs: update wiki for 0.3.2 mascot packages

docs: rewrite wiki structure and guides

docs: 重写 Architecture.md,优化结构和可读性 - 删除重复的目录结构说明 - 合并重复的子模块关系图 - 简化核心组件介绍,使用表格替代长文本 - 优化数据流图表的可读性 - 总行数从 392 行减少到 249 行 Co-authored-by: Sisyphus <clio-agent@sisyphuslabs.ai>

docs: 更新 wiki 文档以匹配新的代码结构 - Architecture.md: 更新目录结构,libshijima 已集成到 src/app/core/shijima-engine/ - Building.md: 更新子模块说明(2个而非3个) - CI-CD.md: 移除过时的 libshijima git 历史获取步骤 - Contributing.md: 更新引擎贡献说明 - Home.md: 更新核心依赖表 Co-authored-by: Sisyphus <clio-agent@sisyphuslabs.ai>

docs: 更新 wiki 文档以匹配新的代码结构 - 更新 Architecture.md: - 目录结构描述(src/app/ 分层为 core/runtime/ui) - 更新所有文件路径到新的位置 - 新增代码组织约定章节 - 更新 Contributing.md: - 文件组织改为分层结构描述 - 新增实现文件命名规范(主体+职责模式)

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