Эндомиксис (от эндо... и греч. míxis - смешение), периодическая перестройка ядерного аппарата у некоторых инфузорий. Открыт в 1914 у Paramecium aurelia американскими учеными Л. Вудреффом и Р. Эрдман, которые описали при Эндомиксис разрушение макронуклеуса и двукратное деление микронуклеуса; часть продуктов деления без слияния (оплодотворения) превращается в макронуклеусы, часть в микронуклеусы, остальные погибают. Позднее было показано, что в таком виде перестройки ядра у инфузорий не бывает - дифференцировке макро- и микронуклеусов предшествует слияние ядер (по типу самооплодотворения, или автогамии ). Следовательно, Эндомиксис - одна из форм полового процесса.