Гетерокарион (от гетеро... и греч. káryon — орех, ядро) клетка, имеющая два или более ядра, различающихся по наследственным (генетическим) свойствам. Гетерокарион широко распространены у грибов, где они возникают при слиянии гиф и при переходе ядер из одной гифы в другую. Содержание в Гетерокарион ядер разных типов может маскировать присущие тому или иному типу биохимические дефекты. Поэтому Гетерокарион может происходить на питательной среде, недостаточной для каждого типа ядер в отдельности. Если клетка при слиянии гиф получает генетически идентичные ядра, она называется гомокарионом.