菅原 秀明

基本情報

所属

国立遺伝学研究所 生命情報・DDBJ研究センターデータベース運用開発研究室 教授

学位

工学博士

J-GLOBAL ID

200901056900605513

researchmap会員ID

1000206285

外部リンク

http://www.cib.nig.ac.jp

研究キーワード

• 生命情報学
• bioinformatics

研究分野

• 環境・農学 / ランドスケープ科学 /
• 環境・農学 / 環境農学 /
• ライフサイエンス / 多様性生物学、分類学 /
• 情報通信 / 知能情報学 /

学歴

• - 1973年

  東京大学, 工学系研究科, 応用物理
• - 1973年

  東京大学

委員歴

• 2000年 - 2004年

  World Federation for Culture Collection, 理事
• 2000年

  日本情報知識学会, 理事
• 2000年

  情報処理学会, 編集委員

受賞

• 1998年

  日本実験動物代替法学会論文賞
• 1984年

  日本科学技術情報センタ-丹羽学術賞

MISC

• Miyazaki, S., Sugawara, H., Gojobori, T., and Tateno, Y., DNA Data Bank of Japan (DDBJ) in XML

  Nucleic Acids Research 31(1), 13-16 2003年
• Sugawara,H., and Miyazaki, S., Web services and genome annotation in GRID by DNA Data Bank of Japan

  Life Science Grid Mini Symposium at GGF7 2003年
• Sugawara, H., Yamaguchi, M., and Gojobori, T., DDBJ together with JBIC proposes Polymorphism Markup Language (PML) for SNPs

  Human Genome Meeting (HGM2003), Cancun (Mexico) 2003年
• Sugawara, H., and Miyazaki, S., Open annotation to genome sequences of microbes

  Genome Informatics, private communication 2003年
• Miyazaki, S., and Sugawara, H., Programmatic interfaces for sequence data retrieval and analysis

  Genome Informatics, private communication 2003年
• Sugawara, H., and Miyazaki S., Biological SOAP Servers and web services provided by the public sequence data bank

  Nucleic Acids Research 31(13), 3836-3839 2003年
• Sugawara, H., Miyazaki, S., AHMII: Agent to Help Microbial Information Integration

  Nucleic Acids Research 31(13), 3727-3728 2003年
• Chenna, R., Sugawara, H., Koike, T., Lopez, R., Gibson, T., Higgins, D. G., and Thompson, J. D., Multiple sequence alignment with the Clustal series of programs

  Nucleic Acids Research 31(13), 3497-3500 2003年
• Nishumura, A., Saka, K., Tadenuma, M., Nishikawa, K., Sugawara, H., Nakabe, S., Matsumoto, N., Itoh, K., Kitagawa, M., and Mori, H., A complete set of E. coli genes/ORFs on a mobile plasmid: successful use in the isolation of all cell division mutants

  International Workshop for Escherichia coli Towards New Biology in the 21th Century, Awajishima 2003年
• Sugawara, H., Web services to control tsunami of data

  International Workshop for Escherichia coli Towards New Biology in the 21th Century, Awajishima 2003年
• 菅原秀明、分類同定支援システムe-Workbench

  平成14年度遺伝研研究集会プログラム「生物遺伝資源の評価(2) 遺伝資源とバイオインフォティマクス」 2003年
• 菅原秀明、生命科学における大規模システム

  有馬朗人監修「これからの大学等研究施設 第2編 生命科学編」、10-3-10-9、科学新聞社(東京) 2003年
• 菅原秀明、OECDにおける生物資源センター報告の進捗状況

  日本微生物資源学会第10回大会、筑波 2003年
• 宮崎智、内野昌孝、田中尚人、内村泰、駒形和男、菅原秀明、数値分類に基づいたクラスターの同定項目を検出するための測度の定式化

  日本微生物資源学会第10回大会、筑波 2003年
• 平畠壮規、田中尚人、丸山譲、宮崎智、菅原秀明、微生物ゲノムシークエンシングの状況とアノテーションの課題

  日本微生物資源学会第10回大会、筑波 2003年
• 田中尚人、宮崎智、菅原秀明、Stenotrophomonas maltophiliaの亜鉛吸蔵の特徴

  日本微生物資源学会第10回大会、筑波 2003年
• 菅原秀明(分担執筆) 、バイオ系のためのインターネット活用法

  2003年
• Miyazaki, S., Sugawara, H., Gojobori, T., and Tateno, Y., DNA Data Bank of Japan (DDBJ) in XML

  Nucleic Acids Research 31(1), 13-16 2003年
• Sugawara,H., and Miyazaki, S., Web services and genome annotation in GRID by DNA Data Bank of Japan

  Life Science Grid Mini Symposium at GGF7 2003年
• Sugawara, H., Yamaguchi, M., and Gojobori, T., DDBJ together with JBIC proposes Polymorphism Markup Language (PML) for SNPs

  Human Genome Meeting (HGM2003), Cancun (Mexico) 2003年

書籍等出版物

• 菅原秀明(編)、バイオインフォマティクスがわかる

  洋土社 2003年
• Epitope databank

  The Information Revolution : Impact on Science and Technology, Springer (Berlin) 1996年

所属学協会

• World Federation for Culture Collection
• 日本情報知識学会
• 情報処理学会

Works(作品等)

• 生物系研究資材ネットワーク

  1997年 - 2001年
• Biological Resources Network

  1997年 - 2001年

共同研究・競争的資金等の研究課題

• 統合生物情報システム
• 生物を対象とする情報ベ-スの研究
• Integrated Information System for Biology
• Study on Information-base for biology
• 生物を対象とする情報ベースの研究
• Bioinformatics