Kasukawa Takeya

• Yokohama City University Graduate School of Medical Life Science Visiting Professor
• Hiroshima University Genome Editing Innovation Center Visiting Professor

• 2022 - 2025 Multiomics on multiple system atrophy
• 2022 - 2025 A multi-omics study on multiple system atrophy patients with family history
• 2021 - 2024 転写ユニティー機構を構築する多因子間相互作用の時空間的かつ定量的解明
• 2021 - 2023 Development of data analysis platform technology for data-driven genomic breeding

• Imad Abugessaisa, Mickey Konings, Ri-Ichiroh Manabe, Cathal M Murphy, Tsugumi Kawashima, Akira Hasegawa, Chitose Takahashi, Michihira Tagami, Yasushi Okazaki, Kimberly Eadie, et al. Iron regulatory pathways differentially expressed during Madurella mycetomatis grain development in Galleria mellonella. Nature communications. 2025. 16. 1. 5324-5324
• Tomoe Nobusada, Chi Wai Yip, Saumya Agrawal, Jessica Severin, Imad Abugessaisa, Akira Hasegawa, Chung Chau Hon, Satoru Ide, Masaru Koido, Atsushi Kondo, et al. Update of the FANTOM web resource: enhancement for studying noncoding genomes. Nucleic acids research. 2025. 53. D1. D419-D424
• Kohta Nakamura, Yukiko Yatsuka, Sachie Naito, Akira Hasegawa, Takeya Kasukawa, Atsushi Kondo, Yoshihito Kishita, Yohei Sugiyama, Takanori Onuki, Tomohiro Ebihara, et al. Successful Diagnosis of Sengers Syndrome Using a Comprehensive Genomic Analysis. Molecular genetics & genomic medicine. 2025. 13. 1. e70048
• Nejc Haberman, Holly Digby, Rupert Faraway, Rebecca Cheung, Anob M. Chakrabarti, Andrew M. Jobbins, Callum Parr, Kayoko Yasuzawa, Takeya Kasukawa, Chi Wai Yip, et al. Widespread 3′UTR capped RNAs derive from G-rich regions in proximity to AGO2 binding sites. BMC Biology. 2024. 22. 1
• Chi Wai Yip, Callum Parr, Hazuki Takahashi, Kayoko Yasuzawa, Matthew Valentine, Hiromi Nishiyori-Sueki, Camilla Ugolini, Valeria Ranzani, Mitsuyoshi Murata, Masaki Kato, et al. CFC-seq: identification of full-length capped RNAs unveil enhancer-derived transcription. 2024

• 三浦巧, 河野掌, 高野慈美, 黒田拓也, 山本由美子, 草川森士, 森岡勝樹, 菅原亨, 澤田留美, 松山さと子, et al. シングルセル解析によるヒト間葉系間質/幹細胞の特性指標探索の試み. 日本再生医療学会総会(Web). 2024. 23rd
• 信定知江, 長谷川哲, WALKER Scott, THALHATH Nishad, 川路英哉, 粕川雄也. 公共データベースからのcis-regulatory elements情報の統合. 日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web). 2024. 47th
• 粕川雄也, SCOTT Walker, 長谷川哲, NISHAD Thalhath, 信定知江, 高田豊行, 桝屋啓志, 川路英哉. fanta.bioシスエレメントの機能アノテーションデータベース. 日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web). 2024. 47th
• 黒田拓也, 安田智, 安田智, 松山さと子, 松山さと子, 三浦巧, 澤田留美, 松山晃文, 森岡勝樹, 粕川雄也, et al. ヒトiPS細胞における神経分化予測マーカーによる神経分化調節機構の解明. 日本再生医療学会総会(Web). 2023. 22nd
• 三浦巧, 河野掌, 高野慈美, 黒田拓也, 山本由美子, 草川森士, 森岡勝樹, 菅原亨, 平井孝昌, 安田智, et al. 単一細胞遺伝子発現解析による間葉系幹細胞の血管新生能予測バイオマーカーの探索. 日本再生医療学会総会(Web). 2023. 22nd

• RNAの分析方法
• 哺乳類の体内時刻の新規なインジケーター、及びその利用

• 生命科学データ解析を支える情報技術
  技術評論社 2019 ISBN:9784297103194
• 生物時計の生態学 : リズムを刻む生物の世界
  文一総合出版 2015 ISBN:9784829962060
• 時間薬理学による最新の治療戦略
  医薬ジャーナル社 2013 ISBN:4753226042
• 体内時計の科学と産業応用 (バイオテクノロジーシリーズ)
  シーエムシー出版 2011 ISBN:4781303404
• 改訂第2版 バイオデータベースとウェブツールの手とり足とり活用法 - 遺伝子の配列・機能解析、タンパク質解析、プロテオミクス、文献検索、検索エンジン...etc.真に役立つサイトを使い倒す!
  羊土社 2007 ISBN:4758108110

• Updating a data warehouse with low traffic cost
  (IPSJ SIG Notes 1997)

• Ph.D (informatics) (Osaka University)

• 2025/04 - 現在 RIKEN RIKEN Center for Integrative Medical Sciences Team Director
• 2025/04 - 現在 Hiroshima University Genome Editing Innovation Center Visiting Professor
• 2022/11 - 現在 University of Tsukuba School of Integrative and Global Majors
• 2022/04 - 現在 Yokohama City University Graduate School of Medical Life Science Visiting Professor
• 2019/10 - 2025/03 RIKEN RIKEN Center for Integrative Medical Sciences Team Leader
2018/10 - 2025/03 Osaka University Institute for Protein Research Visiting Professor
2018/04 - 2019/09 RIKEN RIKEN Center for Integrative Medical Sciences Unit Leader
2013/04 - 2018/03 RIKEN Center for Life Science Technology Unit Leader
2005/04 - 2013/03 RIKEN Center for Developmental Biology Research Scientist
2000/04 - 2005/03 NTT Software Corporation
1998/04 - 2000/03 Osaka University Graduate School of Engineering Assistant professor